La gestión de las condicionalidades del Programa Bolsa Familia se da mediante sistemas informatizados en línea («Sistema de Condicionalidades», «Sistema Presencia» y «Sistema de Gestión del Programa Bolsa Familia en la Salud»), que permiten a los municipios brasileños acceder a los datos de los beneficiarios que deben ser acompañados, además de registrar los datos de frecuencia escolar y de salud de todos los beneficiarios.