Os processos de gestão das condicionalidades estão organizados em diferentes etapas. Elas têm início na geração da base de dados do conjunto de crianças, adolescentes e mulheres que devem ser acompanhados pelas condicionalidades e terminam com a identificação das famílias que as descumpriram. Todos os processos se efetivam por meio de sistemas on-line e ocorrem de forma compartilhada entre os diferentes atores das áreas de educação, saúde e assistência social nos âmbitos federal, estadual e municipal.